يشرف عميد كلية الطب على مستشفى الملك خالد الجامعي ويرتبط بوكيل الجامعة.
الارتباطات التنظيمية لمستشفى الملك خالد الجامعي:

1 -   عميد كلية الطب والمشرف على المستشفيات الجامعية ويرتبط به كل من:

       - وكيل كلية الطب لشؤون المستشفيات الجامعية.
       - إدارة العلاقات العامة.
       - إدارة الجودة.
       - مركز البحوث.

2 -   وكيل كلية الطب لشؤون المستشفيات الجامعية ويرتبط به كل من:

       - كبير الأطباء.
       - المشرف العام على إدارة التموين الطبي.
       - المدير التنفيذي.

3 -   كبير الأطباء ويرتبط به كل من:

       - نائب كبير الأطباء.
       - أقسام المستشفى المختلفة.
       - الطب النووي.
       - بنك الدم.
       - الحوادث والإسعاف.
       - مكتب التحويلات.

4 -   نائب كبير الأطباء ويرتبط به كل من:

       - التمريض.
       - السجلات الطبية.
       - التعقيم المركزي.

5 -   المدير التنفيذي ويرتبط به كل من:

       - التقارير الطبية.
       - التنويم.
       - الحركة.
       - الخدمات العامة والاتصالات الإدارية.
       - خدمات التغذية.
       - الحاسب الآلي والمعلومات.
       - إدارة شؤون الموظفين.